死者家属到出事海域海祭: 

周四是全港哀悼日，悼念南丫岛海难的死难者，政府主要官员和立法会以及多间公私营机构，中午12时默哀3分钟及下半旗，大部分政府服务暂停。

在政府总部东翼广场，梁振英和特区终审法院首席法官马道立、特区政府政务司司长林郑月娥等均身着黑色衣服，神情肃穆，为死难者默哀，期间梁振英感触流泪。默哀期间，除紧急及出入境服务外，其他特区政府服务暂停。当值的特区政府人员在办公地点参与默哀。

梁振英其后同一众问责官员到礼顿山黄泥涌社区会堂签署吊唁册。梁振英写上沉痛哀悼撞船事故的死难者。同行的政务司司长林郑月娥，亦在吊唁册上，写上“沉痛哀悼、主怀安息”。民政事务局长曾德成，写上“海难无情，港人有爱”；保安局长黎栋国写上“安息主怀”；食物及卫生局长高永文就写上“沉痛记念，汲取教训”。他们神情哀伤，签署吊唁册后未有发言就离开。

立法会中午亦举行默哀仪式，30多名候任议员、秘书长陈维安，一批议员助理以及秘书处职员合共100多人，齐集立法会广场旗杆，为海难死者默哀。由于立法会是日安排学生参观，一批幼稚园学生和家长亦加入哀悼。

政府所有建筑物的国旗区旗一连3日下半旗，民政事务总署在全港18区设立吊唁处，供市民悼念3日。至于特区政府驻京办事处的特区区旗则一连3日下半旗致哀。

出事船只之一的港灯公司总部，中午12时有悼念活动，董事总经理曹棨森率领200多名员工默哀。出席的员工穿上黑色衣服，站满港灯公司大堂，他们神情哀伤，部分人低头饮泣。

曹棨森发言时表示，港灯有7名员工在海难中死亡，另4人仍然留医，公司会向他们及家属提供人钉人的跟进工作，支援死伤者家属，港灯亦设立户口，已收集到百多万港元捐款，公司又3次为死难者，进行海上法事。

港灯亦在中环圣约翰座堂举行追思会，超过400名员工及高层出席，参与的人默哀3分钟，现场燃点38支蜡烛，悼念38名死者，牧师并带领祈祷及唱圣诗。而座堂于早上亦特别哀悼事件中的死难者，不少信众都身穿黑色衣服，神情肃穆。

至于和黄和长实旗下物业亦下半旗致哀，旗下公司中午默哀3分钟。

港九小轮员工海难现场致祭

海难另一肇事公司，港九小轮则由总经理伍兆缘率领员工，到南丫岛海难现场海祭，并在撞船事故现场为死难者鸣笛致哀。此外，香港所有的渡轮都在中午12时默哀的时刻鸣响汽笛，表达对死难者的哀思。